單細(xì)胞RNA-seq揭示了細(xì)胞群中固有的細(xì)胞異質(zhì)性，這在許多臨床和研究應(yīng)用中非常重要。液滴微流體學(xué)的最新進(jìn)展已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了液滴隔室中單細(xì)胞的自動(dòng)分離，裂解和標(biāo)記，而無(wú)需復(fù)雜的儀器。然而，細(xì)胞包封過(guò)程中發(fā)生的條形碼錯(cuò)誤是由于珠子中的多珠和由于低濃度的珠子以避免多個(gè)珠子在液滴中而導(dǎo)致的通量不足仍然是精確和有效的表達(dá)譜分析的重要挑戰(zhàn)單細(xì)胞
在這項(xiàng)研究中，三星基因組研究所的研究人員開發(fā)了一種新的基于液滴的微流體平臺(tái)，通過(guò)確定性封裝慣性有序珠子，顯著提高了通量，同時(shí)減少了條形碼錯(cuò)誤。含有寡核苷酸條形碼的高度濃縮的珠子通過(guò)慣性效應(yīng)在螺旋通道中自發(fā)排序，然后逐個(gè)包裹在液滴中，同時(shí)將細(xì)胞同時(shí)包封在液滴中。
盡管珠子濃度增加到1000μl-1，但珠子的確定性包封導(dǎo)致高比例的單珠子在液滴中并且稀有的多珠子在液滴中，這減少了條形碼誤差并且使得精確的高 - 吞吐量條形碼。研究人員用單細(xì)胞RNA-seq成功驗(yàn)證了他們的裝置。此外，他們發(fā)現(xiàn)了多個(gè)珠子在一個(gè)小滴，使用具有高濃度珠子的正常Drop-Seq裝置，低估的轉(zhuǎn)錄物數(shù)量和高估的細(xì)胞數(shù)量產(chǎn)生。這種精確的高通量平臺(tái)可以擴(kuò)展Drop-Seq在單細(xì)胞分析中的能力和實(shí)用性。
移動(dòng)通過(guò)螺旋渠道的小珠的微觀圖象。(比例尺表示500μm)
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